超级计算机的商业价值主要体现在使用超级计算机研发出来的成果，推动产生巨大的社会和经济价值。比如过去传统的新药开发过程中需要对新药潜在化合物进行实验筛选，一种新药从研发、实验到批准进入临床需要至少十几年甚至几十年以上的时间，而在引入超级计算机后可以对数以万计的潜在化合物进行计算机快速筛选，从而大幅缩短筛选周期提高筛选命中率，从而加速新药研发成功并快速进入临床，从而为人类疾病提供更丰富的治疗方案，新药销售也为制药公司创造更多商业价值。