在过去一轮孵化器蓬勃发展中，政府的支持也成为泡沫的推手，财政部和国家税务总局对于孵化器给予了一定税收优惠，不同城市的市区两级对于孵化器发展都给出补贴等优惠政策。

一位知名孵化器的运营经理对《第一财经日报》说，很多以补贴为目的来做的创客空间，导致市场混乱，有的空间为了吸引企业入驻，提出场地免费，而这导致收费的价格也收不上去，行业处于比较混乱的阶段。“已经有很多空间主动提出，不想运营了，希望我们来接手。”

孵化器如果想要突出重围，也要进行转型升级。创业公社创始人、总裁刘循序接受《第一财经日报》记者采访时表示，众创空间发挥的孵化作用很重要，但也面临着转型升级。过去1.0时代，众创空间大多以“二房东”的身份存在，到了2.0时代，则通过市场化机制、专业化服务和资本化途径构建低成本、便利化、全要素、开放式的新型创业服务平台，这一阶段，众创空间的角色更像是“服务员”。不过，现在企业的发展需要众创空间进入到3.0时代，为创业企业构筑创新生态圈，整合对接行业、政府、投资者、高校、产业的资源、资金和人才，实现产融结合，加速企业增长。

3.0时代的孵化器，要拼项目、拼资源、拼服务，需要“背靠大树”。

一些知名企业也纷纷出手开办孵化器和众创空间。腾讯于9月宣布，有30个腾讯众创空间在全国落地，总共面积超过100万平方米，形成了创服、创孵、创投、创培、创星、创联为主的六大众创生态战略。阿里云也在3月29日宣布，要打造中国最大的互联网创业平台，并在当天获得超过10亿元的总意向投资金额。

作为基因产业的龙头企业华大基因，也在2015年做起了生命健康领域的孵化器蓝色彩虹知识产权平台。蓝色彩虹CEO刘靓对《第一财经日报》记者表示，孵化器本质是要建立一个生态系统，这就包括创业人才、资金和大众接受度。在人才方面，从基因应用的领域去挖掘，蓝色彩虹目前在每个领域都有和基因技术可以结合的储备项目；在资金方面，蓝色彩虹的一期基金三亿元，未来，还将运营数十亿的政府引导基金。未来蓝色彩虹会成为集合技术平台、数据平台、商务平台、资本平台、政策法规平台、知识产权平台为一体的孵化器。

孵化器背后的资本和名企实力让孵化器的服务更切合创业企业的需求。以松禾资本为例，其迄今投资了200多家企业，有36家上市或被并购，11家在新三板挂牌，入驻松禾创新的创业企业和这些上市公司之间的化学反应可想而知。